私立旧制医科大学とは旧六医科大学と同時期に設立された慶應義塾大学医学部、東京慈恵会医科大学、日本医科大学のことである。これらの大学を医学部受験予備校などでは私立医大の御三家とも呼んでいる。基本的には開業医養成学校としての役割を果たしてきたが、研究機関としても多くの実績を積んできており、教授の純血率も高い。