旗艦(きかん、Flagship)とは、海軍用語で、司令官または司令長官が座乗し、指令・命令を発する艦である。
無線による情報伝達(無線通信)が無い19世紀以前には、洋上での情報伝達は主として「旗旒信号(きりゅうしんごう」という旗によって伝達する方法であった。そこで司令官の指令・命令は、座乗する艦のマストに複数の旗として掲げられ、この旗(旗旒)を掲げる艦を旗艦とよんだ。
読み方: きかん
英語: Flagship